內(nèi)切酶一般從微生物中獲取，限制性核酸內(nèi)切酶的作用實際就是限制酶降解外源DNA，維護宿主遺傳穩(wěn)定的保護機制。自身DNA沒有被分解的原因是通過自身DNA甲基化，甲基化是常見的修飾作用，可使腺嘌呤A和胞嘧啶C甲基化而受到保護，即讓它們在甲基轉移酶的作用下，與甲基發(fā)生共價結合。通過甲基化作用達到識別自身遺傳物質和外來遺傳物質的目的。